Marker Name: Vf_Mt3g114850_001 |
||
| Map Name | SNP-based consensus genetic map: 2016 | |
| Marker Type | SNP | |
| Linkage Group & Location cM | Linkage Group: group-Vf_Chr_2 Location cM: 50.39 | |
| Parents SNP Call | NV643-4 call: A:A NV648-1 call: A:A | |
| Target Sequence | ATCTTCTCAACGCTCCTGGTGAGACTTACAGCGTTAAGTTGGATGCTAAGGGTACCTACA AATTCTACTGCTCACCTCACCAAGGAGCTGGTATGGTTGG[R]CAAGTCACTGTTAATTA AATTAAAATGCTTTGTATCATCTTTATAATATGGTTTGTTCATGTTAATTTTGTTCTTGT AATAGAGCTTAATTAATCGTTGT |
|
| SNP Position | 100 | |
| NV643-3 allele (sequence) | ATCTTCTCAACGCTCCTGGTGAGACTTACAGCGTTAAGTTGGATGCTAAGGGTACCTACA AATTCTACTGCTCACCTCACCAAGGAGCTGGTATGGTTGGGCAAGTCACTGTTAATTAAA TTAAAATGCTTTGTATCATCTTTATAATATGGTTTGTTCATGTTAATTTTGTTCTTGTAA TAGAGCTTAATTAATCGTTGT |
|
| NV648-1 allele (sequence) | ATCTTCTCAACGCTCCTGGTGAGACTTACAGCGTTAAGTTGGATGCTAAGGGTACCTACA AATTCTACTGCTCACCTCACCAAGGAGCTGGTATGGTTGGACAAGTCACTGTTAATTAAA TTAAAATGCTTTGTATCATCTTTATAATATGGTTTGTTCATGTTAATTTTGTTCTTGTAA TAGAGCTTAATTAATCGTTGT |
|
| EH/PIC | 0.198 | |
| Reference | Webb et al. 2016 link | |
NCBI Alignment Result (Nucleotide BLAST) |
||
| Sequence Similarity | NCBI Accession Number: X16082.1 NCBI Gene Symbol: - | |
| Gene Description | gene for plastocyanin | |
| Similar Organisms | Pea | |
| Alignment Scores | Identity Percentage: 95.025 Mismatches: 10 Open Gaps: 0 Evalue: 1.15E-082 | |